Dar 2018 m. Valstybinė teritorijų planavimo ir statybos inspekcija prie Aplinkos ministerijos (Statybos inspekcija), atlikusi patikrinimą, nustatė, kad į kultūros vertybių registrą įtraukto statinio paprastojo remonto darbai atliekami pažeidžiant 2014 m. parengto projekto, kuriam pritarė Vilniaus m. savivaldybės administracija, sprendinius. Statytojui UAB „Vilniaus Žalgirio dengtas plaukimo baseinas“ buvo surašytas privalomasis nurodymas pašalinti pažeidimus, tačiau nurodymo bendrovė neįvykdė. Statybos inspekcija kreipėsi į antstolį prašydama pradėti priverstinį vykdymą, bet, prasidėjus teismų procesams, priverstinis privalomojo nurodymo vykdymas buvo sustabdytas.
2021 m. spalio 27 d. Vilniaus miesto apylinkės teismas, išnagrinėjęs ieškovo Vilniaus apygardos prokuratūros prokuroro, ginančio viešąjį interesą, civilinę bylą dėl statybą leidžiančių dokumentų (SLD) panaikinimo ir statybos padarinių pašalinimo bei žalos atlyginimo nusprendė panaikinti Vilniaus m. savivaldybės administracijos 2014 m. rašytinį pritarimą ir 2017 m. išduotą SLD. Teismas sprendimu įpareigojo UAB „Vilniaus Žalgirio dengtas plaukimo baseinas“ savo, Vilniaus m. savivaldybės administracijos ir Kultūros paveldo departamento prie Kultūros ministerijos lėšomis (lygiomis dalimis) per 3 mėnesius nuo sprendimo įsiteisėjimo dienos pašalinti savavališkos statybos pagal neteisėtai išduotus SLD padarinius.
Teismo sprendime taip pat nurodyta, kad UAB „Vilniaus Žalgirio dengtas plaukimo baseinas“ savo lėšomis per 3 mėnesius nuo sprendimo įsiteisėjimo dienos privalo nugriauti (pašalinti) tarp pastato, esančio Gedimino pr. 27 / A. Jakšto g. 2, Vilniuje, kolonų išlietą pamatą, plytelių dangą, stiklo sienas (blokus) su durimis ir, sutvarkius statybvietę, atstatyti (atkurti) statinį ir teritoriją į buvusią padėtį.
Neįvykdžius teismo sprendimu nurodytų įpareigojimų (pašalinti statybos padarinius) per nustatytą terminą, UAB „Vilniaus Žalgirio dengtas plaukimo baseinas“ turės valstybės naudai mokėti 100 Eur dydžio baudą už kiekvieną uždelstą reikalavimo neįvykdymo dieną, skaičiuojant nuo termino, per kurį privaloma pašalinti neteisėtos statybos padarinius, pasibaigimo.
